《基因工程》课已成为生物技术教学计划中重要的核心课程，其内容为生命科学的相关骨干课程的建设和改造提供了必要条件，促进了新的课程体系的建设。其主要内容包括基因操作的工具酶、载体、PCR技术、核酸的分离、凝胶电泳、分子杂交、基因文库的构建、酵母双杂交系统、DNA测序等技术的基本原理及这些技术在个生物中的应用部分：大肠杆菌基因工程、真菌基因工程、昆虫基因工程、动物基因工程、植物基因工程以及蛋白质工程和途径工程。《分子克隆技术实验》部分主要包括DNA的PCR扩增、凝胶电泳、DNA重组、感受态细胞的制备转化及阳性克隆的筛选、质粒的提取、酶切及回收、原核表达载体的构建、原核表达及SDS-PAGE检测、植物基因组DNA的提取及农杆菌介导法和花粉管通道法转化植物，其中原核表达载体的构建、原核表达及SDS-PAGE检测是综合性实验，农杆菌介导法和花粉管通道法转化植物是设计性实验。本课程要求学生掌握基本概念、基本原理、基本操作技术和主要应用技术的基础上通过文献报告的形式进行课程应用方面的阅读及讨论，另外给学生介绍近三年的生物类诺贝尔奖项的内容及与本课程相关的研究前研究动态，以拓宽学生的视野，提高学生的兴趣。